Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TROQ12816 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TROQ12816 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TROQ12816 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TROQ12816 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TROQ12816 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TROQ12816 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TROQ12816 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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