Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF5Q12774 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms