Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOX4Q06945 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms