Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN11Q06124 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms