Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms