Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP2BQ02880 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TOP2BQ02880 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms