Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms