Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIK1P57059 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIK1P57059 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms