Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRPF1P55201 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms