Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms