Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms