Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAMP50895 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAMP50895 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAMP50895 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAMP50895 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAMP50895 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms