Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK1EP49674 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms