Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PXNP49023 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PXNP49023 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PXNP49023 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PXNP49023 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms