Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms