Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPB2P35606 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPB2P35606 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPB2P35606 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPB2P35606 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms