Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms