Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP1P30622 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms