Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HTR2AP28223 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms