Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APCP25054 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APCP25054 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APCP25054 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APCP25054 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APCP25054 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APCP25054 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APCP25054 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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