Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK11BP21127 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK11BP21127 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK11BP21127 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK11BP21127 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK11BP21127 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK11BP21127 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK11BP21127 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK11BP21127 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms