Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2CP19387 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms