Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFAP15692 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms