Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms