Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP1P11387 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP1P11387 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP1P11387 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms