Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD2P0DJD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms