Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4BP0C0L5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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