Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NGFRP08138 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NGFRP08138 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms