Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLK3P07288 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLK3P07288 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLK3P07288 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLK3P07288 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLK3P07288 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLK3P07288 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLK3P07288 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLK3P07288 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLK3P07288 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLK3P07288 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms