Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RHOH-216ENST00000515718 574 ntTSL 47.49□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXOSC8-210ENST00000490537 2423 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CLASP2-219ENST00000487553 825 ntTSL 37.48□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LARP4-218ENST00000552445 722 ntTSL 37.45□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPIDR-228ENST00000588781 164 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-210ENST00000509883 2659 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-GPRASP2-208ENST00000602366 573 ntTSL 47.41□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC44A5-203ENST00000469525 721 ntTSL 57.35□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCO2-217ENST00000532716 711 ntTSL 27.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCO2-216ENST00000532673 619 ntTSL 27.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCO2-207ENST00000525175 588 ntTSL 57.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NR6A1-204ENST00000475178 742 ntTSL 37.32□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL2-206ENST00000528609 1798 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPN1-206ENST00000589704 250 ntTSL 57.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF720-213ENST00000544044 572 ntTSL 57.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHB-209ENST00000508009 451 ntTSL 57.23□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COCH-204ENST00000468826 2129 ntTSL 27.22□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-223ENST00000557679 846 ntTSL 57.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF678-204ENST00000465266 533 ntTSL 47.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCTD10-212ENST00000541077 538 ntTSL 37.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STKLD1-204ENST00000475232 266 ntTSL 37.17□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 57.15□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-GPRASP2-202ENST00000460793 755 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRMT5-206ENST00000454731 617 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SDCCAG8-209ENST00000493334 711 ntTSL 57.13□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NEPRO-215ENST00000474311 1671 ntTSL 27.12□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DGKH-208ENST00000626247 3045 ntTSL 27.11□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBM22-205ENST00000521248 660 ntTSL 27.09□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DIABLO-207ENST00000446652 573 ntTSL 37.07□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-203ENST00000399721 2229 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RFC5-203ENST00000449641 572 ntTSL 47.06□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RAPGEF6-211ENST00000512611 3683 ntTSL 1 (best)7.05□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZDHHC13-204ENST00000525490 6304 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DNAJC7-210ENST00000588641 782 ntTSL 37.01□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRDM7-205ENST00000569206 693 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF143-205ENST00000412390 554 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAPD5-201ENST00000357464 7233 ntTSL 56.99□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-203ENST00000398139 2461 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PKNOX1-207ENST00000557820 537 ntTSL 46.9□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NFIB-222ENST00000638165 1783 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 56.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.322e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC26A2-203ENST00000503336 618 ntTSL 36.8□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RSPRY1-207ENST00000563073 699 ntTSL 36.78□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HEATR5A-206ENST00000550366 2687 ntTSL 26.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BRD9-219ENST00000523139 580 ntTSL 36.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF530-204ENST00000598297 4367 nt6.7□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 56.7□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAFAH1B2-207ENST00000533206 685 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PSMF1-206ENST00000418246 326 ntTSL 36.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-208ENST00000554316 769 ntTSL 36.63□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARMCX5-GPRASP2-201ENST00000460026 645 ntTSL 36.59□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMA1-225ENST00000543450 3339 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-211ENST00000437114 753 ntTSL 56.56□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KLHL23-203ENST00000437875 895 ntTSL 36.51□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SRRD-203ENST00000477945 607 ntTSL 56.5□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCAS3-208ENST00000586241 558 ntTSL 56.5□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SOX6-216ENST00000533658 1202 ntTSL 26.5□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM241-210ENST00000577531 590 ntTSL 46.49□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NRG3-209ENST00000602794 3530 ntTSL 26.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LARP4-216ENST00000550522 567 ntTSL 46.32□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMYD4-205ENST00000571854 586 ntTSL 46.3□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1212.1 ms