Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms