Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP3O43295 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms