Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBDO15205 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBDO15205 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBDO15205 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms