Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD1AO15047 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms