Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms