Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPIPA5E9PKD4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms