Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L5A8MUK1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms