Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SERINC4A6NH21 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms