Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37CA5D8V6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms