Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN3Q13064 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN3Q13064 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
MKRN3Q13064 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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