Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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