Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LSAMPQ13449 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LSAMPQ13449 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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