Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms