Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRNQ16849 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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PTPRNQ16849 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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