Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3663-201ENST00000583207 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms