Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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