Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCINQ13939 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCINQ13939 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCINQ13939 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCINQ13939 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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