Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SDSP20132 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SDSP20132 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SDSP20132 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SDSP20132 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SDSP20132 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SDSP20132 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SDSP20132 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SDSP20132 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SDSP20132 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SDSP20132 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SDSP20132 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SDSP20132 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.4 ms