Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXQ1Q9C009 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXQ1Q9C009 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXQ1Q9C009 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXQ1Q9C009 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXQ1Q9C009 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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