Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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